Война Священного Грааля: жестокая битва между магами, в которой семь мастеров и их призванные слуги сражаются за Святой Грааль, магический артефакт, который может даровать победителю любое желание. Почти 10 лет назад Последняя битва четвертой войны Святого Грааля нанесла ущерб городу Фуюки и унесла более 500 жизней, оставив город опустошенным.
Широ Эмия, переживший эту трагедию, стремится стать героем справедливости, как его спаситель и приемный отец, Кирицугу Эмия. Несмотря на это, только будучи студентом Широ бросается в пятую войну Святого Грааля, когда он случайно видит битву между слугами в школе и призывает своего собственного слугу, Сэйбер.
Когда таинственная тень начинает убийственное веселье в городе Фуюки, Широ присоединяется к Рин Тосаке, соучастнику войны Святого Грааля, чтобы остановить гибель бесчисленного количества людей. Тем не менее, чувства Широ к его близкому другу Сакуре Мато ведут его глубже в темные тайны, окружающие войну и враждующие семьи.