Спустя три года после бегства Когами Сивилла выходит на границы Японии: в рамках эксперимента эту уникальную систему начинают внедрять в «проблемных» странах для ликвидации внутренних конфликтов и построения мирного общества. Первым плацдармом такого эксперимента становится Юго-Восточный Африканский Союз (ЮВАС), раздираемый гражданской войной. Если верить сообщениям СМИ, Системе удалось достичь мира в отдельно взятом городе, и жители Японии надеются, что однажды их благополучие распространится на весь мир.

Инспектору Цунэмори и ее подчиненным выпадает шанс воочию увидеть результаты работы Сивиллы за границей после того, как в Японии появляется террористическая группа родом из ЮВАС. Дело в том, что силами инспектора Симоцуки Сивилла получила в свое распоряжение воспоминания одного из террористов и нашла в них человека, до которого давно хочет добраться – Синью Когами. В настоящий момент он воюет в ЮВАС, и перед агентами Бюро во главе с Цунэмори ставится задача найти его и обеспечить безопасность Сивиллы.